check16S rRNA gene sequencing 서비스

    저희 GENOBIOME에서는

    대변 샘플 및 환경 샘플과 같은 다양한 복합 미생물이 포함된
    샘플 내에서의 미생물의 식별, 분류 및 정량화를 위해
    16S rRNA gene sequencing 서비스를 제공하고 있습니다.

    저희가 제공하는 16S rRNA sequencing은 박테리아와 같은 원핵 생물에서 발견되는 ribosome의 small subunit (SSU)를 코드하는 16S rRNA 유전자를
    시퀀싱하는 것을 의미
    합니다. 16S rRNA 유전자 (conserved genes이 존재하는 9 개의 hypervariable regions 포함)는 가변성 때문에 분류학적
    구분이 가능한 곳으로 GENOBIOME에서는 16S rRNA 유전자의 V1-V3 regions(27F-519R), V3-V4 regions (341F-806R), V4 regions(515F-806R)
    등을 타켓으로 하여 서비스를 제공
    해 드리고 있습니다.

    응용분야

    • ·Gut Microbiome
    • ·Environmental Samples (ex soil, water)
    • ·Clinical Samples

    장점

    • ·Identification efficiency: 기존의 identification 방법인 cloning 또는 culturing 방법과 비교하여 16S rRNA sequencing은 보다 빠르고 정확한 방법입니다.
    • ·Lower cost: metagenomic sequencing에 비해 요구되는 depth가 훨씬 낮아 동일한 가격으로 더 많은 샘플을 분석할 수 있습니다.
    • ·Higher sensitivity: 매우 적은 양의 박테리아 샘플로도 진행 할 수 있습니다.

    Project Workflow

    • Sample Preparation
    • PCR Amplification
    • Library Preparation
    • Sequencing
    • Raw Data Output
    • Bioinformatics Analysis
    • Sample QC

    • Fragment QC

    • Data QC

    • Library QC